Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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ARL2-SNX15V9GYD0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ARL2-SNX15V9GYD0 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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