Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9Y3F1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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