Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMG5Q9UPR3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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