Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLF1Q9BQI6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLF1Q9BQI6 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms