Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACAP3Q96P50 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACAP3Q96P50 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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