Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GTF3C6Q969F1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GTF3C6Q969F1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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