Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC112Q8NEF3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC112Q8NEF3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms