Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM139Q8IV31 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms