Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms