Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PAPD7Q5XG87 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms