Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CMTM1-215ENST00000531885 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ALOX12P1-201ENST00000579299 1229 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC239859.5-201ENST00000614100 1232 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 APOC3-201ENST00000227667 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PPP3CB-AS1-201ENST00000422977 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 snoZ6.3-201ENST00000583496 76 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CALM3-206ENST00000594523 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC109826.1-203ENST00000624259 1105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TMEM255B-205ENST00000488362 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEP350Q5VT06 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms