Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CTXN3Q4LDR2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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