Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
KRTAP13-4Q3LI77 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms