Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GAPVD1Q14C86 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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