Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FOXD4Q12950 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXD4Q12950 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXD4Q12950 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FOXD4Q12950 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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