Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms