Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABPAQ06546 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms