Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ARID5AQ03989 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ARID5AQ03989 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms