Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDC42EP1Q00587 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.9 ms