Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC4P56524 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC4P56524 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC4P56524 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms