Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK8P49336 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDK8P49336 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms