Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PIP4K2AP48426 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms