Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TSPOP30536 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TSPOP30536 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TSPOP30536 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TSPOP30536 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TSPOP30536 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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