Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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