Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PRKCHP24723 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PRKCHP24723 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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