Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RLBP1P12271 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms