Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
GLI4P10075 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms