Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CDH13-210ENST00000567445 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MYL2-201ENST00000228841 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC02549-201ENST00000445346 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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ATXN8OSP0DMR3 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 C5orf58-202ENST00000517575 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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ATXN8OSP0DMR3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ATXN8OSP0DMR3 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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ATXN8OSP0DMR3 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PSMC1-202ENST00000543772 1389 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC117457.1-201ENST00000614557 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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