Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
LINC00588Q9Y4M8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms