Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
DKK2Q9UBU2 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms