Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CNN2P1-201ENST00000453616 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 IGHV3OR16-11-201ENST00000565524 349 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 FCER1A-201ENST00000368114 765 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CC2D2AQ9P2K1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms