Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCDC88CQ9P219 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCDC88CQ9P219 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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