Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms