Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms