Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RSPRY1Q96DX4 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms