Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSRNP3Q8WYN3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSRNP3Q8WYN3 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms