Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBM43Q6ZSC3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms