Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATL3Q6DD88 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms