Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ATP1A4Q13733 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms