Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
FMODQ06828 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
FMODQ06828 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms