Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CHRNEQ04844 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CHRNEQ04844 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms