Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD3P84022 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms