Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBP5P82980 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBP5P82980 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBP5P82980 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms