Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASIC1P78348 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ASIC1P78348 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms