Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PIP4K2AP48426 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms