Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GJA8P48165 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GJA8P48165 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms