Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGAEP38570 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms