Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GJC1P36383 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GJC1P36383 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms