Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OTX2P32243 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OTX2P32243 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
OTX2P32243 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms