Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HRCP23327 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HRCP23327 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HRCP23327 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HRCP23327 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms